หลังจากที่ทบวงมหาวิทยาลัยประกาศนโยบายและแนวปฏิบัติในการประกันคุณภาพการศึกษาระดับอุดมศึกษา เมื่อวันที่ 8 กรกฎาคม 2539 แล้ว มหาวิทยาลัยเกริกได้รับเอานโยบายดังกล่าวมาดำเนินการประกันคุณภาพการศึกษาของมหาวิทยาลัย ตั้งแต่ พ.ศ. 2541 โดยมหาวิทยาลัยประกาศนโยบายและแนวปฏิบัติในการประกันคุณภาพการศึกษามหาวิทยาลัยเกริกและแต่งตั้งคณะกรรมการบริหารการประกันคุณภาพการศึกษา มีการเผยแพร่ความรู้เกี่ยวกับการประกันคุณภาพการศึกษา และเตรียมการจัดระบบการประกันคุณภาพการศึกษา ในปีการศึกษา 2543 โดยแต่งตั้งคณะทำงานประกันคุณภาพการศึกษาเพื่อจัดทำคู่มือประกันคุณภาพการศึกษาในระดับมหาวิทยาลัย / คณะวิชาและหน่วยงานสนับสนุน ภายในมหาวิทยาลัยเกริก และเสริมสร้างความเข้าใจในการประกันคุณภาพการศึกษาเพื่อให้มีการนำนโยบายการประกันคุณภาพการศึกษาสู่การปฏิบัติ โดยเชิญวิทยากรผู้ทรงคุณวุฒิเป็นผู้เสริมสร้างความเข้าใจ และเริ่มกระบวนการวิเคราะห์ตนเองและเขียนรายงานการศึกษาตนเอง ประจำปีการศึกษา 2543

เมื่อสภามหาวิทยาลัยมีมติในการประชุม ครั้งที่ 3 / 2543 อนุมัติให้จัดตั้งสำนักประกันคุณภาพการศึกษาเป็นหน่วยงานดำเนินงานประกันคุณภาพการศึกษา ในวันที่ 10 สิงหาคม 2543 และมีคำสั่งแต่งตั้งผู้อำนวยการสำนักประกันคุณภาพการศึกษา เมื่อวันที่ 25 กันยายน 2544 เป็นผู้รับผิดชอบการดำเนินกิจกรรมการประกันคุณภาพการศึกษาของการศึกษาของมหาวิทยาลัยสำนักประกันคุณภาพการศึกษา จึงได้จัดทำแผนดำเนินงานประกันคุณภาพการศึกษาภายใต้กรอบแผนพัฒนามหาวิทยาลัยเกริก ฉบับที่ 4 ระยะเวลา 5 ปี ( พ.ศ. 2550 - 2555 ) ปรับปรุงกลไกการประกันคุณภาพการศึกษาภายในมหาวิทยาลัยเกริก โดยแต่งตั้งคณะกรรมการประกันคุณภาพการศึกษาและในระดับคณะ / สำนัก / สถาบัน / ศูนย์ เพื่อให้มีการดำเนินการประกันคุณภาพการศึกษาอย่างเป็นระบบและมีความต่อเนื่อง เผยแพร่หลักการ แนวความคิด และกิจกรรมเกี่ยวกับการประกันคุณภาพการศึกษาแก่บุคลากรภายในมหาวิทยาลัยเกริก รวมถึงบุคคลภายนอก และสังคมทั่วไป เพื่อสร้างวัฒนธรรมคุณภาพในการทำงานของมหาวิทยาลัย ซึ่งเป็นกระบวนการสร้าง “ คน ” ที่มีคุณภาพของสังคม